De lá para cá, foram dois vice-campeonatos brasileiros, o primeiro na própria Copa João Havelange, diante do Vasco da Gama, e no ano seguinte, contra o atual líder do Brasileirão desta temporada, o Atlético-PR.
Em 2002, o São Caetano ficou também com o vice-campeonato da maior competição Sul-Americana, a Copa Libertadores da América, quando perdeu para o Olímpia do Paraguai, nos pênaltis, no Pacaembu.
Mas 2004 tem sido a melhor temporada dos últimos quatro anos, desde sua chegada à elite. O time conquistou seu primeiro título de expressão, o Paulistão, caiu nas quartas-de-final da Libertadores, na Argentina, nas cobranças de pênalti contra o Boca Juniors, e segue na quarta colocação do Campeonato Brasileiro. Tem, em seu favor, a defesa menos vazada do torneiro e espera surpreender o São Paulo no Morumbi para voltar ao terceiro lugar.
É também o reencontro das duas equipes após a eliminação do Azulão na Copa Sul-Americana, mais uma vez nas cobranças de pênaltis mal efetuadas pelos zagueiros Thiago e Gustavo, depois que Euller perdeu uma cobrança nos minutos finais da partida.
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