A Ilha do Tamanduá, a maior de Caraguatatuba, também não escapa dos cliques dos visitantes. Eles podem visitá-la para apreciar de perto os seus encantos naturais. O acesso é feito por meio de barcos, que saem das praias Mococa, Cocanha e Tabatinga. Outro recanto é o Ilhote da Cocanha.

O Morro Santo Antônio, por sua vez, oferece uma vista privilegiada da enseada formada por Caraguatatuba e São Sebastião, tendo ao fundo as belezas de Ilhabela. Para chegar ao mirante, basta ter disposição e encarar a caminhada, que deve ser feita em grupos.

Outra opção de ecoturismo é o Parque Estadual da Serra do Mar. Além das trilhas, os visitantes podem se refrescar com mergulhos nas piscinas naturais e cachoeiras.

A cidade também conta com formações rochosas bem peculiares. Programe-se para conhecer a Pedra da Freira, localizada na praia de mesmo nome, também conhecida como Garcez. A rocha lembra a imagem de uma freira ajoelhada e admirando o mar.

Outra escultura natural é a Pedra do Jacaré. Como o nome indica, tem o formato do réptil. Uma pequena trilha leva o visitante até o local, situado na Prainha.