Capistrano morreu na última sexta-feira, aos 52 anos, com falência múltipla dos órgaos, após ser submetido a uma cirurgia de transplante de fígado no hospital Sírio Libanês, em Sao Paulo . Seu corpo foi sepultado no Memorial Necrópole Ecumênica.
Além de prefeito de 1993 a 1996, ele foi secretário de Saúde. Capistrano deixou esposa e quatro filhos.
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