Nunes era investigado pelo Ministério Público pela ligação com Andinho e pela suposta participação no assassinato do prefeito Antonio da Costa Santos. Porém, ele não aparecia nos seqüestros nos quais a quadrilha de Andinho estava envolvida.

O promotor Ricardo Silvares afirmou que é preciso investigar as circunstâncias em que Nego foi morto. Há informações ainda não comprovadas de que a arma que matou Toninho, uma pistola 9 milímetros, poderia estar com ele.