Em um telegrama enviado ao bispo de Quibdó, através do cardeal Angelo Sodano, secretário de Estado, o papa expressou seu "profundo pesar pela triste notícia do execrável atentado perpetrado pela guerrilha com bombas incendiárias, causando um grande número de mortos e feridos entre a população civil refugiada na igreja de Bellavista, em Bojayá".

Em sua carta, divulgada pela assessoria de imprensa do Vaticano, o pontífice expressou sua "mais enérgica reprovação por estes novos atos de terrorismo" e enviou seus mais "sentidos pêsames às famílias das vítimas".