Diferentemente dos outros times deste Campeonato Brasileiro, o elenco são-paulino aproveita a parada para a Copa do Mundo para se preparar sim, mas com o objetivo focado na Copa Libertadores da América, da qual é o atual campeão. No dia 19 de julho, o Tricolor recebe o Estudiantes, da Argentina, no jogo de volta das quartas-de-final da competição sul-americana.

Na primeira partida, o São Paulo perdeu por 1 a 0 fora de casa. Precisa reverter o resultado para chegar à semifinal, sem contar com o zagueiro uruguaio Lugano, que foi expulso na Argentina. Mas contará com Rogério Ceni e Mineiro, que estão na Seleção Brasileira. Em caso de uma vitória simples, a partida irá para os pênaltis. O empate é dos argentinos.

Apesar da concentração absoluta no Estudiantes, a partida de volta do São Paulo após a Copa é pelo Brasileiro. Uma semana antes do jogo da Libertadores, dia 12 de julho, o time recebe o Grêmio no Morumbi.