Durante o conflito da Bósnia (1992-1995), o aeroporto ficou sob o controle das tropas de paz da ONU, que o converteu em espaço neutro, proibido aos combatentes de ambos campos.
O Alto Comissariado das Nações Unidas para os Refugiados utilizava o aeroporto para levar ajuda humanitária à capital bósnia, apesar do ataque da artilharia servo-bósnia.
Após a assinatura dos acordos de paz de Dayton (1995), o aeroporto passou ao controle da Força de Estabilização da Otan na Bósnia.
Em 1996, o aeroporto foi oficialmente aberto ao tráfego aéreo pelo então secretário de Estado americano Warren Christopher.
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